Vou enviar uma proposta genérica, por que seria melhor primeiro discutir sobre alguns pontos.
Entendo que hoje vocês só usam o o sistema em Access, e não usam ferramentas como da NeoInterativa ou CobrebemX.
Pelo pedido de proposta, vocês ficariam com 3 sistemas: Access, NeoInterativa/CobrebemX e um intermediário traduzindo (que é desta proposta). Sinceramente, não me parece boa ideia.
Ofereço duas alternativas de solução, acho que mais interessantes:
-Desenvolver um software para gerar remessas e ler retornos de boletos, a partir dos dados do Access, e emitir em PDF (ou similiar, para impressão) os boletos customizados para empresa de vocês. Vocês teriam o trabalho de enviar esses boletos, por correios ou e-mail. Ainda assim, é possível implementar no software uma rotina para enviar por e-mails esses boletos.
-Fazer o mesmo software de remessa e retorno, só que passar a responsabilidade de impressão e envio dos boletos ao seu banco. Basta mudar o contrato de boletos para outra carteira, o banco cobra uma taxa a mais por esse serviço. Seria um problema a menos para se preocupar.